Prva supruga
Tom Kruza bila je
Mimi Rodžers, sa kojom je bio u braku od 1987. do 1990. godine, a upravo je ona uvela glumca u sajentologiju.
Tom se 1990. godine oženio sa koleginicom
Nikol Kidman, sa kojom je bio u braku sve do 2001. godine, a razveli su se takođe kada je Nikol imala 33 godine. Dok su bili u bračnoj zajednici Tom i Nikol su usvojili dvoje dece ćerku Izabelu Džejn i sina Konora Enotina.
Kruz se 2006. godine oženio koleginicom
Kejti Holms i sa njom je bio do 2012. godine. Oni su dobili i ćerkicu Suri koja je rođena 2006. godine, a razveli su se kada je Kejti imala 33 godine.